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Forum TERATEC 2017
Atelier 2 - Mercredi 28 juin de 9h00 à 12h30
Santé - Perspectives pour une médecine personnalisée en 2025

Challenges calculatoires et de modélisation poses par l'épidémiologie des maladies infectieuses
Lulla OPATOWSKI, Assistant professor in Mathematical Epidemiology at the University of Versailles Saint Quentin (UVSQ), Biomathematics biostatistics pharmacopepidemiology-and-infectious-diseases_Unit-UMR 1181 Inserm/ Institut Pasteur & UVSQ

Résumé : L’acquisition et la transmission des pathogènes dans les populations est un phénomène complexe qui a lieu sur plusieurs échelles (échelle populationnelle pour la transmission, échelles de l’hôte et du micro-organisme pour la colonisation). La modélisation mathématique a été très largement utilisée ces dernières années pour étudier ces phénomènes, permettant d’une part de mener in silico des expériences non réalisables en pratique, et d’autre part l’analyse poussée de données biologiques par l’estimation de paramètres clefs cachés ou inconnus. Cependant, la plupart de ces modèles se limitent à l’échelle de la population et donc à la question de la transmission. Ainsi il a été possible de fournir en temps réel des prédictions pour aider à  la mise en œuvre du contrôle de maladies émergentes telles que les virus Ebola ou Zika dans des grandes populations. Envisager dans le futur une telle utilisation des modèles mathématiques pour une médecine personnalisée au niveau de l’individu ou le contrôle de la transmission d’un pathogène dans une petite population telle qu’un service hospitalier nécessitera d’augmenter considérablement notre puissance de calcul. En effet, à ces échelles, les phénomènes sont fortement multi-factoriels et des modèles plus complexes et avec une grande stochasticité sont nécessaires. Dans cette présentation je détaillerai autour de quelques exemples précis les challenges et enjeux pour les prochaines années.

Biographie : Lulla Opatowski is assistant professor in Mathematical Epidemiology at the University of Versailles Saint Quentin (UVSQ) working in the “Biostatistics, Biomathematics, Pharmacoepidemiology and Infectious Diseases” (B2PHI) unit, UMR1181 (Versailles Saint Quentin university, Inserm, Institut Pasteur) research group which includes physicians, epidemiologists, biologists, biomathematicians and biostatisticians. Her main research interests are in mathematical and computational modelling of infectious disease and statistical inference, with a particular interest in bacterial resistance to antimicrobials (including antibiotics and vaccines) and host-pathogen-pathogen interactions. Some of her projects include the modelling of interactions between respiratory bacteria and influenza viruses in humans, the modelling of transmission of nosocomial pathogens in hospitals using detailed proximity contact data, the modelling of gut microbiota and the impact of its dynamics on the acquisition of antibiotic resistant bacteria.

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Forum Teratec 2016 : Technologies et usages du HPC dans le secteur de la Santé

Forum Teratec 2014 : HPC et Santé : De la recherche thérapeutique à la médecine personnalisée

Forum Teratec 2013 : Le HPC dans la santé

 

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