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Atelier 02 de 16h00 à 18h00
Maladies transmissibles ou troubles de la vision:
évaluation, compréhension, correction et contrôle avec l’apport de la modélisation et du calcul
La modélisation par agents au service de l'étude du risque épidémique de SARS-Cov-2 et de son contrôle en milieu hospitalier
Par Lulla Opatowski, Chercheur Epidémiologiste, Institut Pasteur
L’acquisition et la transmission des pathogènes dans les populations est un phénomène complexe qui a lieu sur plusieurs échelles (échelle populationnelle pour la transmission, échelles de l’hôte et du micro-organisme pour la colonisation). La modélisation mathématique a été très largement utilisée ces dernières années pour mieux comprendre les épidémies. L’augmentation des capacités calculatoire permet aujourd’hui de développer des modèles sophistiquées en parallèle de la mise en place investigations épidémiologiques exploitant les technologies récentes de microbiologie et technologies de l’information.
Les lieux de soin, par leur nature, sont particulièrement à risque épidémique. Les hôpitaux sont souvent confrontés à des épidémies de grippe, de bactéries résistantes aux antibiotiques et plus récemment SARS-CoV-2. Lorsque ces épidémies ont lieu, pour protéger les populations vulnérables prises en charge dans ces lieux, une mise en place de mesures de contrôle réactive est nécessaire, mais c’est au prix de fortes désorganisations et également de coûts élevés pour l’hôpital. Optimiser cette mise en place de mesure est complexe : elle nécessite de bien comprendre et d’intégrer la variabilité et les caractéristiques des forces à l’origine de ces épidémies en population hospitalière. Dans ce contexte, la modélisation agents est particulièrement appropriée. Les modèles peuvent être utilisés pour analyser des épidémies mais aussi simuler des scénarios contrefactuels permettant d’identifier des scenarios de stratégies de contrôle optimales. Dans le cadre de cette conférence, je détaillerai les modèles développés par nos équipes et leur utilisation pour l’étude de la transmission de SARS-CoV-2 dans les milieux de soin en 2020-2021.
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Biographie : Lulla Opatowski est Professeure à l’université de Versailles St Quentin en Yvelines (UVSQ). Elle est membre du “Centre for Epidemiology and Population Health” research group (CESP, Inserm/UVSQ, et l’unité « Epidemiology and modelling of bacterial evasion » à l’Institut Pasteur. Sa recherche porte sur la modélisation mathématique, la simulation informatique et l’inférence statistique pour l’étude de la transmission des maladies infectieuses dans les populations, avec un intérêt particulier pour la résistance bactérienne aux antibiotiques et les interactions entre pathogènes au sein des hôtes humains. Ses projets incluent la modélisation des interactions entre les virus respiratoires et les bactéries du tractus respiratoire pour l’infection de l’Homme ; la modélisation de la transmission de pathogènes nosocomiaux dans les hôpitaux à partir de données détaillées relatives aux contacts entre individus ; et enfin la modélisation du microbiote et son impact sur l’acquisition de bactéries résistantes aux antibiotiques. Cette dernière années, une grande partie de son travail a été dédié à la modélisation de la transmission et la surveillance de SARS-CoV-2 en population, à la fois dans la communauté et dans des petites populations plus spécifiques comme les lieux de soin.. |
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