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Forum TERATEC 2017
Atelier 2 - Mercredi 28 juin de 9h00 à 12h30
Santé - Perspectives pour une médecine personnalisée en 2025

De la modélisation moléculaire à la médecine personnalisée
Vincent ZOETE, Molecular Modeling Group – SIB Swiss Institute of Bioinformatics Computer-Aided Molecular Engineering Group – Département d’Oncologie Fondamentale – Université de Lausanne

Résumé : La modélisation moléculaire des macromolécules biologiques est couramment appliquée à l’étude et à la compréhension de leur structure, de leur comportement dynamique et de leur activité. Mais ces techniques peuvent aussi être mises à profit pour prédire les changements structuraux et comportementaux engendrés par la mutation de protéines, ou leur interaction avec de petites molécules organiques. Dans cet exposé, nous montrerons comment ces méthodes nous permettent de contribuer à l’ingénierie des protéines, ou à la conception de médicaments, notamment dans le domaine de l’immunothérapie du cancer.

Plus récemment, le champ d’application de la modélisation moléculaire s’est vu étendu par la médecine personnalisée. En effet, les techniques de séquençage de nouvelle génération permettent d’identifier rapidement les mutations présentes chez un patient. Leur analyse met en évidence les mutations pathogéniques et celles pouvant influencer l’efficacité et le choix d’un traitement. Toutefois, les mutations qui n’ont pas encore été caractérisées expérimentalement, et dont l’effet potentiel est toujours inconnu, restent nombreuses. Face à ces cas, la modélisation moléculaire peut apporter des réponses quant au rôle potentiellement joué par ces nouvelles mutations dans l’apparition de la maladie, et contribuer à choisir le traitement médical le plus approprié à un patient donné. Des exemples d’applications de la modélisation moléculaire dans cette médecine personnalisée, tirés du ‘Molecular Tumor Board’ des hôpitaux de Lausanne, Genève et Fribourg, seront présentés.

Biographie : Vincent Zoete a obtenu un diplôme d’ingénieur chimiste à l’ENSCL (Lille, France) et un DEA de Chimie Organique et Macromoléculaire en 1995, avant d’entamer sa thèse en chimie organique dans le Laboratoire de Chimie Organique et Macromoléculaire de l’université de Lille. Durant cette période, il obtient un Mastère en Drug Design en 1996 à Lille. Après avoir effectué son service militaire en 1997, à l’Etat Major de la Marine à Paris, il termine sa thèse de doctorat en 1999. Il commence ensuite un PostDoctorat en Modélisation Moléculaire à Strasbourg, dans le laboratoire du Prof. Martin Karplus, prix Nobel de Chimie 2013, tout en travaillant pour Enanta Pharmaceuticals (Cambridge, MA, USA). En 2003/2004, il travaille comme PostDoc conjointement dans les laboratoires de Martin Karplus et Markus Meuwly, à Strasbourg (France) et Bâle (Suisse). Il rejoint ensuite l’Institut Suisse de Bioinformatique en tant que Responsable de Recherche dans le Groupe de Modélisation Moléculaire dirigé par le Prof. Olivier Michielin. Il en devient le directeur de groupe adjoint en 2011. En 2017, il est nommé Professeur Assistant ‘tenure track’ en Modélisation Moléculaire dans le Département d’Oncologie Fondamentale de l’Université de Lausanne, branche Lausannoise de l’Institut Ludwig.

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Retrouver les ateliers techniques du Forum TERATEC traitant du HPC dans la santé et télécharger les présentations

Forum Teratec 2016 : Technologies et usages du HPC dans le secteur de la Santé

Forum Teratec 2014 : HPC et Santé : De la recherche thérapeutique à la médecine personnalisée

Forum Teratec 2013 : Le HPC dans la santé

 

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